Hungarian
Albanian
Arabic
Armenian
Azerbaijani
Belarusian
Bengali
Bosnian
Catalan
Czech
Danish
Deutsch
Dutch
English
Estonian
Finnish
Français
Greek
Haitian Creole
Hebrew
Hindi
Hungarian
Icelandic
Indonesian
Irish
Italian
Japanese
Korean
Latvian
Lithuanian
Macedonian
Mongolian
Norwegian
Persian
Polish
Portuguese
Romanian
Russian
Serbian
Slovak
Slovenian
Spanish
Swahili
Swedish
Turkish
Ukrainian
Vietnamese
Български
中文(简体)
中文(繁體)
International Journal of Molecular Sciences 2019-Nov

A Multiple Protease Strategy to Optimise the Shotgun Proteomics of Mature Medicinal Cannabis Buds.

Csak regisztrált felhasználók fordíthatnak cikkeket
Belépés Regisztrálás
A hivatkozás a vágólapra kerül
Delphine Vincent
Vilnis Ezernieks
Simone Rochfort
German Spangenberg

Kulcsszavak

Absztrakt

Earlier this year we published a method article aimed at optimising protein extraction from mature buds of medicinal cannabis for trypsin-based shotgun proteomics (Vincent, D., et al. Molecules2019, 24, 659). We then developed a top-down proteomics (TDP) method (Vincent, D., et al. Proteomes2019, 7, 33). This follow-up study aims at optimising the digestion of medicinal cannabis proteins for identification purposes by bottom-up and middle-down proteomics (BUP and MDP). Four proteases, namely a mixture of trypsin/LysC, GluC, and chymotrypsin, which target different amino acids (AAs) and therefore are orthogonal and cleave proteins more or less frequently, were tested both on their own as well as sequentially or pooled, followed by nLC-MS/MS analyses of the peptide digests. Bovine serum albumin (BSA, 66 kDa) was used as a control of digestion efficiency. With this multiple protease strategy, BSA was reproducibly 97% sequenced, with peptides ranging from 0.7 to 6.4 kD containing 5 to 54 AA residues with 0 to 6 miscleavages. The proteome of mature apical buds from medicinal cannabis was explored more in depth with the identification of 27,123 peptides matching 494 unique accessions corresponding to 229 unique proteins from Cannabis sativa and close relatives, including 130 (57%) additional annotations when the list is compared to that of our previous BUP study (Vincent, D., et al. Molecules2019, 24, 659). Almost half of the medicinal cannabis proteins were identified with 100% sequence coverage, with peptides composed of 7 to 91 AA residues with up to 9 miscleavages and ranging from 0.6 to 10 kDa, thus falling into the MDP domain. Many post-translational modifications (PTMs) were identified, such as oxidation, phosphorylations, and N-terminus acetylations. This method will pave the way for deeper proteome exploration of the reproductive organs of medicinal cannabis, and therefore for molecular phenotyping within breeding programs.

Csatlakozzon
facebook oldalunkhoz

A legteljesebb gyógynövény-adatbázis, amelyet a tudomány támogat

  • Működik 55 nyelven
  • A tudomány által támogatott gyógynövényes kúrák
  • Gyógynövények felismerése kép alapján
  • Interaktív GPS térkép - jelölje meg a gyógynövényeket a helyszínen (hamarosan)
  • Olvassa el a keresésével kapcsolatos tudományos publikációkat
  • Keresse meg a gyógynövényeket hatásuk szerint
  • Szervezze meg érdeklődését, és naprakész legyen a hírkutatással, a klinikai vizsgálatokkal és a szabadalmakkal

Írjon be egy tünetet vagy betegséget, és olvassa el azokat a gyógynövényeket, amelyek segíthetnek, beírhat egy gyógynövényt, és megtekintheti azokat a betegségeket és tüneteket, amelyek ellen használják.
* Minden információ publikált tudományos kutatáson alapul

Google Play badgeApp Store badge