Hungarian
Albanian
Arabic
Armenian
Azerbaijani
Belarusian
Bengali
Bosnian
Catalan
Czech
Danish
Deutsch
Dutch
English
Estonian
Finnish
Français
Greek
Haitian Creole
Hebrew
Hindi
Hungarian
Icelandic
Indonesian
Irish
Italian
Japanese
Korean
Latvian
Lithuanian
Macedonian
Mongolian
Norwegian
Persian
Polish
Portuguese
Romanian
Russian
Serbian
Slovak
Slovenian
Spanish
Swahili
Swedish
Turkish
Ukrainian
Vietnamese
Български
中文(简体)
中文(繁體)
Protein Science 2001-Oct

Ligand diffusion in the catalase from Proteus mirabilis: a molecular dynamics study.

Csak regisztrált felhasználók fordíthatnak cikkeket
Belépés Regisztrálás
A hivatkozás a vágólapra kerül
P Amara
P Andreoletti
H M Jouve
M J Field

Kulcsszavak

Absztrakt

The role of the channels and cavities present in the catalase from Proteus mirabilis (PMC) was investigated using molecular dynamics (MD) simulations. The reactant and products of the reaction, H(2)O(2) -->1/2 O(2) + H(2)O, catalyzed by the enzyme were allowed to diffuse to and from the active site. Dynamic fluctuations in the structure are found necessary for the opening of the major channel, identified in the X-ray model, which allows access to the active site. This channel is the only pathway to the active site observed during the dynamics, and both the products and reactant use it. H(2)O and O(2) are also detected in a cavity defined by the heme and Ser196, which could play an important role during the reaction. Free energy profiles of the ligands diffusing through the major channel indicate that the barriers to ligand diffusion are less than 20 kJ mol(-1) for each of the species. It is not clear from our study that minor channels play a role for access to the protein active site or to the protein surface.

Csatlakozzon
facebook oldalunkhoz

A legteljesebb gyógynövény-adatbázis, amelyet a tudomány támogat

  • Működik 55 nyelven
  • A tudomány által támogatott gyógynövényes kúrák
  • Gyógynövények felismerése kép alapján
  • Interaktív GPS térkép - jelölje meg a gyógynövényeket a helyszínen (hamarosan)
  • Olvassa el a keresésével kapcsolatos tudományos publikációkat
  • Keresse meg a gyógynövényeket hatásuk szerint
  • Szervezze meg érdeklődését, és naprakész legyen a hírkutatással, a klinikai vizsgálatokkal és a szabadalmakkal

Írjon be egy tünetet vagy betegséget, és olvassa el azokat a gyógynövényeket, amelyek segíthetnek, beírhat egy gyógynövényt, és megtekintheti azokat a betegségeket és tüneteket, amelyek ellen használják.
* Minden információ publikált tudományos kutatáson alapul

Google Play badgeApp Store badge