Hungarian
Albanian
Arabic
Armenian
Azerbaijani
Belarusian
Bengali
Bosnian
Catalan
Czech
Danish
Deutsch
Dutch
English
Estonian
Finnish
Français
Greek
Haitian Creole
Hebrew
Hindi
Hungarian
Icelandic
Indonesian
Irish
Italian
Japanese
Korean
Latvian
Lithuanian
Macedonian
Mongolian
Norwegian
Persian
Polish
Portuguese
Romanian
Russian
Serbian
Slovak
Slovenian
Spanish
Swahili
Swedish
Turkish
Ukrainian
Vietnamese
Български
中文(简体)
中文(繁體)
BMC Genomics 2016-11

Pinpointing genes underlying annual/perennial transitions with comparative genomics.

Csak regisztrált felhasználók fordíthatnak cikkeket
Belépés Regisztrálás
A hivatkozás a vágólapra kerül
Andrew J Heidel
Christiane Kiefer
George Coupland
Laura E Rose

Kulcsszavak

Absztrakt

Transitions between perennial and an annual life history occur often in plant lineages, but the genes that control whether a plant is an annual or perennial are largely unknown. To identify genes that confer differences between annuals and perennials we compared the gene content of four pairs of sister lineages (Arabidopsis thaliana/Arabidopsis lyrata, Arabis montbretiana/Arabis alpina, Arabis verna/Aubrieta parviflora and Draba nemorosa/Draba hispanica) in the Brassicaceae in which each pair contains one annual and one perennial, plus one extra annual species (Capsella rubella).

After sorting all genes in all nine species into gene families, we identified five families in which well-annotated genes are present in the perennials A. lyrata and A. alpina, but are not present in any of the annual species. For the eleven genes in perennials in these families, an orthologous pseudogene or otherwise highly diverged gene was found in the syntenic region of the annual species in six cases. The five candidate families identified encode: a kinase, an oxidoreductase, a lactoylglutathione lyase, a F-box protein and a zinc finger protein. By comparing the active gene in the perennial to the pseudogene or heavily altered gene in the annual, dN and dS were calculated. The low dN/dS values in one kinase suggest that it became pseudogenized more recently, while the other kinase, F-box, oxidoreductase and zinc-finger became pseudogenized closer to the divergence between the annual-perennial pair.

We identified five gene families that may be involved in the life history switch from perennial to annual. Considering the dN and dS data and whether syntenic pseudogenes were found and the potential functions of the genes, the F-box family is considered the most promising candidate for future functional studies to determine if it affects life history.

Csatlakozzon
facebook oldalunkhoz

A legteljesebb gyógynövény-adatbázis, amelyet a tudomány támogat

  • Működik 55 nyelven
  • A tudomány által támogatott gyógynövényes kúrák
  • Gyógynövények felismerése kép alapján
  • Interaktív GPS térkép - jelölje meg a gyógynövényeket a helyszínen (hamarosan)
  • Olvassa el a keresésével kapcsolatos tudományos publikációkat
  • Keresse meg a gyógynövényeket hatásuk szerint
  • Szervezze meg érdeklődését, és naprakész legyen a hírkutatással, a klinikai vizsgálatokkal és a szabadalmakkal

Írjon be egy tünetet vagy betegséget, és olvassa el azokat a gyógynövényeket, amelyek segíthetnek, beírhat egy gyógynövényt, és megtekintheti azokat a betegségeket és tüneteket, amelyek ellen használják.
* Minden információ publikált tudományos kutatáson alapul

Google Play badgeApp Store badge