Hebrew
Albanian
Arabic
Armenian
Azerbaijani
Belarusian
Bengali
Bosnian
Catalan
Czech
Danish
Deutsch
Dutch
English
Estonian
Finnish
Français
Greek
Haitian Creole
Hebrew
Hindi
Hungarian
Icelandic
Indonesian
Irish
Italian
Japanese
Korean
Latvian
Lithuanian
Macedonian
Mongolian
Norwegian
Persian
Polish
Portuguese
Romanian
Russian
Serbian
Slovak
Slovenian
Spanish
Swahili
Swedish
Turkish
Ukrainian
Vietnamese
Български
中文(简体)
中文(繁體)
Plant Physiology and Biochemistry 2005-Sep

HPLC analysis of plant DNA methylation: a study of critical methodological factors.

רק משתמשים רשומים יכולים לתרגם מאמרים
התחבר הרשם
הקישור נשמר בלוח
Jason W Johnston
Keith Harding
David H Bremner
Graham Souch
Jon Green
Paul T Lynch
Brian Grout
Erica E Benson

מילות מפתח

תַקצִיר

HPLC analysis of nucleosides is important for determining total DNA methylation in plants and can be used to help characterise epigenetic changes during stress, growth and development. This is of particular interest for in vitro plant cultures as they are highly susceptible to genetic change. HPLC methodologies have been optimised for mammalian and microbial DNA, but not for plants. This study examines critical methodological factors in the HPLC analysis of plant DNA methylation using in vitro cultures of Ribes ciliatum. HPLC revealed that complete removal of RNA from plant DNA extractions is difficult using RNase (A and T1) digestions and LiCl precipitation. This suggests that base analysis should be avoided when using these RNA removal techniques, as bases from residual RNA fragments will inflate peak areas for DNA-derived bases. Nucleoside or nucleotide analysis is therefore recommended as a more suitable option as RNA and DNA constituents can be readily separated. DNA digestion was also a critical factor as methylation was under-estimated following incomplete nuclease digestion and over-estimated following incomplete phosphatase digestion. The units of enzyme required for complete DNA digestion was optimised and found to be 20-200 times less for nuclease P1 and 15 times less for alkaline phosphatase as compared with previous protocols. Digestion performance was conveniently monitored using marker peaks that indicate incomplete digestion products. This study identifies critical components of HPLC analysis and offers a comprehensive guide for the stringent analysis of DNA methylation in plants.

הצטרפו לדף הפייסבוק שלנו

המאגר השלם ביותר של צמחי מרפא המגובה על ידי המדע

  • עובד ב 55 שפות
  • מרפא צמחי מרפא מגובה על ידי מדע
  • זיהוי עשבי תיבול על ידי דימוי
  • מפת GPS אינטראקטיבית - תייגו עשבי תיבול במיקום (בקרוב)
  • קרא פרסומים מדעיים הקשורים לחיפוש שלך
  • חפש עשבי מרפא על פי השפעותיהם
  • ארגן את תחומי העניין שלך והתעדכן במחקר החדשות, הניסויים הקליניים והפטנטים

הקלד סימפטום או מחלה וקרא על צמחי מרפא שעשויים לעזור, הקלד עשב וראה מחלות ותסמינים שהוא משמש נגד.
* כל המידע מבוסס על מחקר מדעי שפורסם

Google Play badgeApp Store badge