Hebrew
Albanian
Arabic
Armenian
Azerbaijani
Belarusian
Bengali
Bosnian
Catalan
Czech
Danish
Deutsch
Dutch
English
Estonian
Finnish
Français
Greek
Haitian Creole
Hebrew
Hindi
Hungarian
Icelandic
Indonesian
Irish
Italian
Japanese
Korean
Latvian
Lithuanian
Macedonian
Mongolian
Norwegian
Persian
Polish
Portuguese
Romanian
Russian
Serbian
Slovak
Slovenian
Spanish
Swahili
Swedish
Turkish
Ukrainian
Vietnamese
Български
中文(简体)
中文(繁體)
International Journal of Molecular Sciences 2015-Sep

Identification of Ramie Genes in Response to Pratylenchus coffeae Infection Challenge by Digital Gene Expression Analysis.

רק משתמשים רשומים יכולים לתרגם מאמרים
התחבר הרשם
הקישור נשמר בלוח
Yongting Yu
Liangbin Zeng
Zhun Yan
Touming Liu
Kai Sun
Taotao Zhu
Aiguo Zhu

מילות מפתח

תַקצִיר

Root lesion disease, caused by Pratylenchus coffeae, seriously impairs the growth and yield of ramie, an important natural fiber crop. The ramie defense mechanism against P. coffeae infection is poorly understood, which hinders efforts to improve resistance via breeding programs. In this study, the transcriptome of the resistant ramie cultivar Qingdaye was characterized using Illumina sequence technology. About 46.3 million clean pair end (PE) reads were generated and assembled into 40,826 unigenes with a mean length of 830 bp. Digital gene expression (DGE) analysis was performed on both the control roots (CK) and P. coffeae-challenged roots (CH), and the differentially expressed genes (DEGs) were identified. Approximately 10.16 and 8.07 million cDNA reads in the CK and CH cDNA libraries were sequenced, respectively. A total of 137 genes exhibited different transcript abundances between the two libraries. Among them, the expressions of 117 and 20 DEGs were up- and down-regulated in P. coffeae-challenged ramie, respectively. The expression patterns of 15 candidate genes determined by qRT-PCR confirmed the results of DGE analysis. Time-course expression profiles of eight defense-related genes in susceptible and resistant ramie cultivars were different after P. coffeae inoculation. The differential expression of protease inhibitors, pathogenesis-related proteins (PRs), and transcription factors in resistant and susceptible ramie during P. coffeae infection indicated that cystatin likely plays an important role in nematode resistance.

הצטרפו לדף הפייסבוק שלנו

המאגר השלם ביותר של צמחי מרפא המגובה על ידי המדע

  • עובד ב 55 שפות
  • מרפא צמחי מרפא מגובה על ידי מדע
  • זיהוי עשבי תיבול על ידי דימוי
  • מפת GPS אינטראקטיבית - תייגו עשבי תיבול במיקום (בקרוב)
  • קרא פרסומים מדעיים הקשורים לחיפוש שלך
  • חפש עשבי מרפא על פי השפעותיהם
  • ארגן את תחומי העניין שלך והתעדכן במחקר החדשות, הניסויים הקליניים והפטנטים

הקלד סימפטום או מחלה וקרא על צמחי מרפא שעשויים לעזור, הקלד עשב וראה מחלות ותסמינים שהוא משמש נגד.
* כל המידע מבוסס על מחקר מדעי שפורסם

Google Play badgeApp Store badge