Hebrew
Albanian
Arabic
Armenian
Azerbaijani
Belarusian
Bengali
Bosnian
Catalan
Czech
Danish
Deutsch
Dutch
English
Estonian
Finnish
Français
Greek
Haitian Creole
Hebrew
Hindi
Hungarian
Icelandic
Indonesian
Irish
Italian
Japanese
Korean
Latvian
Lithuanian
Macedonian
Mongolian
Norwegian
Persian
Polish
Portuguese
Romanian
Russian
Serbian
Slovak
Slovenian
Spanish
Swahili
Swedish
Turkish
Ukrainian
Vietnamese
Български
中文(简体)
中文(繁體)
BioMed Research International 2016

Transcriptome Analysis of Ramie (Boehmeria nivea L. Gaud.) in Response to Ramie Moth (Cocytodes coerulea Guenée) Infestation.

רק משתמשים רשומים יכולים לתרגם מאמרים
התחבר הרשם
הקישור נשמר בלוח
Liangbin Zeng
Airong Shen
Jia Chen
Zhun Yan
Touming Liu
Zhaodong Xue
Yongting Yu

מילות מפתח

תַקצִיר

The ramie moth Cocytodes coerulea Guenée (RM) is an economically important pest that seriously impairs the yield of ramie, an important natural fiber crop. The molecular mechanisms that underlie the ramie-pest interactions are unclear up to date. Therefore, a transcriptome profiling analysis would aid in understanding the ramie defense mechanisms against RM. In this study, we first constructed two cDNA libraries derived from RM-challenged (CH) and unchallenged (CK) ramie leaves. The subsequent sequencing of the CH and CK libraries yielded 40.2 and 62.8 million reads, respectively. Furthermore, de novo assembling of these reads generated 26,759 and 29,988 unigenes, respectively. An integrated assembly of data from these two libraries resulted in 46,533 unigenes, with an average length of 845 bp per unigene. Among these genes, 24,327 (52.28%) were functionally annotated by predicted protein function. A comparative analysis of the CK and CH transcriptome profiles revealed 1,980 differentially expressed genes (DEGs), of which 750 were upregulated and 1,230 were downregulated. A quantitative real-time PCR (qRT-PCR) analysis of 13 random selected genes confirmed the gene expression patterns that were determined by Illumina sequencing. Among the DEGs, the expression patterns of transcription factors, protease inhibitors, and antioxidant enzymes were studied. Overall, these results provide useful insights into the defense mechanism of ramie against RM.

הצטרפו לדף הפייסבוק שלנו

המאגר השלם ביותר של צמחי מרפא המגובה על ידי המדע

  • עובד ב 55 שפות
  • מרפא צמחי מרפא מגובה על ידי מדע
  • זיהוי עשבי תיבול על ידי דימוי
  • מפת GPS אינטראקטיבית - תייגו עשבי תיבול במיקום (בקרוב)
  • קרא פרסומים מדעיים הקשורים לחיפוש שלך
  • חפש עשבי מרפא על פי השפעותיהם
  • ארגן את תחומי העניין שלך והתעדכן במחקר החדשות, הניסויים הקליניים והפטנטים

הקלד סימפטום או מחלה וקרא על צמחי מרפא שעשויים לעזור, הקלד עשב וראה מחלות ותסמינים שהוא משמש נגד.
* כל המידע מבוסס על מחקר מדעי שפורסם

Google Play badgeApp Store badge