Macedonian
Albanian
Arabic
Armenian
Azerbaijani
Belarusian
Bengali
Bosnian
Catalan
Czech
Danish
Deutsch
Dutch
English
Estonian
Finnish
Français
Greek
Haitian Creole
Hebrew
Hindi
Hungarian
Icelandic
Indonesian
Irish
Italian
Japanese
Korean
Latvian
Lithuanian
Macedonian
Mongolian
Norwegian
Persian
Polish
Portuguese
Romanian
Russian
Serbian
Slovak
Slovenian
Spanish
Swahili
Swedish
Turkish
Ukrainian
Vietnamese
Български
中文(简体)
中文(繁體)
Heredity 2018-May

Conserved noncoding sequences conserve biological networks and influence genome evolution.

Само регистрираните корисници можат да преведуваат статии
Пријавете се / пријавете се
Врската е зачувана во таблата со исечоци
Jianbo Xie
Kecheng Qian
Jingna Si
Liang Xiao
Dong Ci
Deqiang Zhang

Клучни зборови

Апстракт

Comparative genomics approaches have identified numerous conserved cis-regulatory sequences near genes in plant genomes. Despite the identification of these conserved noncoding sequences (CNSs), our knowledge of their functional importance and selection remains limited. Here, we used a combination of DNA methylome analysis, microarray expression analyses, and functional annotation to study these sequences in the model tree Populus trichocarpa. Methylation in CG contexts and non-CG contexts was lower in CNSs, particularly CNSs in the 5'-upstream regions of genes, compared with other sites in the genome. We observed that CNSs are enriched in genes with transcription and binding functions, and this also associated with syntenic genes and those from whole-genome duplications, suggesting that cis-regulatory sequences play a key role in genome evolution. We detected a significant positive correlation between CNS number and protein interactions, suggesting that CNSs may have roles in the evolution and maintenance of biological networks. The divergence of CNSs indicates that duplication-degeneration-complementation drives the subfunctionalization of a proportion of duplicated genes from whole-genome duplication. Furthermore, population genomics confirmed that most CNSs are under strong purifying selection and only a small subset of CNSs shows evidence of adaptive evolution. These findings provide a foundation for future studies exploring these key genomic features in the maintenance of biological networks, local adaptation, and transcription.

Придружете се на нашата
страница на Facebook

Најкомплетната база на податоци за лековити билки поддржана од науката

  • Работи на 55 јазици
  • Лекови од билки поддржани од науката
  • Препознавање на билки по слика
  • Интерактивна GPS мапа - означете ги билките на локацијата (наскоро)
  • Прочитајте научни публикации поврзани со вашето пребарување
  • Пребарувајте лековити билки според нивните ефекти
  • Организирајте ги вашите интереси и останете во тек со истражувањето на новостите, клиничките испитувања и патентите

Напишете симптом или болест и прочитајте за билки што можат да помогнат, напишете билка и видете болести и симптоми против кои се користи.
* Сите информации се базираат на објавени научни истражувања

Google Play badgeApp Store badge