Macedonian
Albanian
Arabic
Armenian
Azerbaijani
Belarusian
Bengali
Bosnian
Catalan
Czech
Danish
Deutsch
Dutch
English
Estonian
Finnish
Français
Greek
Haitian Creole
Hebrew
Hindi
Hungarian
Icelandic
Indonesian
Irish
Italian
Japanese
Korean
Latvian
Lithuanian
Macedonian
Mongolian
Norwegian
Persian
Polish
Portuguese
Romanian
Russian
Serbian
Slovak
Slovenian
Spanish
Swahili
Swedish
Turkish
Ukrainian
Vietnamese
Български
中文(简体)
中文(繁體)
Frontiers in Plant Science 2014

VitisCyc: a metabolic pathway knowledgebase for grapevine (Vitis vinifera).

Само регистрираните корисници можат да преведуваат статии
Пријавете се / пријавете се
Врската е зачувана во таблата со исечоци
Sushma Naithani
Rajani Raja
Elijah N Waddell
Justin Elser
Satyanarayana Gouthu
Laurent G Deluc
Pankaj Jaiswal

Клучни зборови

Апстракт

We have developed VitisCyc, a grapevine-specific metabolic pathway database that allows researchers to (i) search and browse the database for its various components such as metabolic pathways, reactions, compounds, genes and proteins, (ii) compare grapevine metabolic networks with other publicly available plant metabolic networks, and (iii) upload, visualize and analyze high-throughput data such as transcriptomes, proteomes, metabolomes etc. using OMICs-Viewer tool. VitisCyc is based on the genome sequence of the nearly homozygous genotype PN40024 of Vitis vinifera "Pinot Noir" cultivar with 12X v1 annotations and was built on BioCyc platform using Pathway Tools software and MetaCyc reference database. Furthermore, VitisCyc was enriched for plant-specific pathways and grape-specific metabolites, reactions and pathways. Currently VitisCyc harbors 68 super pathways, 362 biosynthesis pathways, 118 catabolic pathways, 5 detoxification pathways, 36 energy related pathways and 6 transport pathways, 10,908 enzymes, 2912 enzymatic reactions, 31 transport reactions and 2024 compounds. VitisCyc, as a community resource, can aid in the discovery of candidate genes and pathways that are regulated during plant growth and development, and in response to biotic and abiotic stress signals generated from a plant's immediate environment. VitisCyc version 3.18 is available online at http://pathways.cgrb.oregonstate.edu.

Придружете се на нашата
страница на Facebook

Најкомплетната база на податоци за лековити билки поддржана од науката

  • Работи на 55 јазици
  • Лекови од билки поддржани од науката
  • Препознавање на билки по слика
  • Интерактивна GPS мапа - означете ги билките на локацијата (наскоро)
  • Прочитајте научни публикации поврзани со вашето пребарување
  • Пребарувајте лековити билки според нивните ефекти
  • Организирајте ги вашите интереси и останете во тек со истражувањето на новостите, клиничките испитувања и патентите

Напишете симптом или болест и прочитајте за билки што можат да помогнат, напишете билка и видете болести и симптоми против кои се користи.
* Сите информации се базираат на објавени научни истражувања

Google Play badgeApp Store badge