Vietnamese
Albanian
Arabic
Armenian
Azerbaijani
Belarusian
Bengali
Bosnian
Catalan
Czech
Danish
Deutsch
Dutch
English
Estonian
Finnish
Français
Greek
Haitian Creole
Hebrew
Hindi
Hungarian
Icelandic
Indonesian
Irish
Italian
Japanese
Korean
Latvian
Lithuanian
Macedonian
Mongolian
Norwegian
Persian
Polish
Portuguese
Romanian
Russian
Serbian
Slovak
Slovenian
Spanish
Swahili
Swedish
Turkish
Ukrainian
Vietnamese
Български
中文(简体)
中文(繁體)
Frontiers in Plant Science 2016

Genome-Wide Transcriptional Excavation of Dipsacus asperoides Unmasked both Cryptic Asperosaponin Biosynthetic Genes and SSR Markers.

Chỉ người dùng đã đăng ký mới có thể dịch các bài báo
Đăng nhập Đăng ký
Liên kết được lưu vào khay nhớ tạm
Jian-Ying Wang
Yan-Li Liang
Mei-Rong Hai
Jun-Wen Chen
Zheng-Jie Gao
Qian-Qian Hu
Guang-Hui Zhang
Sheng-Chao Yang

Từ khóa

trừu tượng

BACKGROUND

Dipsacus asperoides is a traditional Chinese medicinal crop. The root is generally used as a medicine and is frequently prescribed by Chinese doctors for the treatment of back pain, limb paralysis, flutter trauma, tendon injuries, and fractures. With the rapid development of bioinformatics, research has been focused on this species at the gene or molecular level. For purpose of fleshing out genome information about D. asperoides, in this paper we conducted transcriptome analysis of this species.

RESULTS

To date, many genes encoding enzymes involved in the biosynthesis of triterpenoid saponins in D.asperoides have not been elucidated. Illumina paired-end sequencing was employed to probe D. asperoides's various enzymes associated with the relevant mesostate. A total of 30, 832,805 clean reads and de novo spliced 43,243 unigenes were obtained. Of all unigenes, only 8.27% (3578) were successfully annotated in total of seven public databases: Nr, Nt, Swiss-Prot, GO, KOG, KEGG, and Pfam, which might be attributed to the poor studies on D. asperoides. The candidate genes encoding enzymes involved in triterpenoid saponin biosynthesis were identified and experimentally verified by reverse transcription qPCR, encompassing nine cytochrome P450s and 17 UDP-glucosyltransferases. Specifically, unearthly putative genes involved in the glycosylation of hederagenin were acquired. Simultaneously, 4490 SSRs from 43,243 examined sequences were determined via bioinformatics analysis.

CONCLUSIONS

This study represents the first report on the use of the Illumina sequence platform on this crop at the transcriptome level. Our findings of candidate genes encoding enzymes involved in Dipsacus saponin VI biosynthes is provide novel information in efforts to further understand the triterpenoid metabolic pathway on this species. The initial genetics resources in this study will contribute significantly to the genetic breeding program of D. asperoides, and are beneficial for clinical diagnosis and treatment.

Tham gia trang
facebook của chúng tôi

Cơ sở dữ liệu đầy đủ nhất về dược liệu được hỗ trợ bởi khoa học

  • Hoạt động bằng 55 ngôn ngữ
  • Phương pháp chữa bệnh bằng thảo dược được hỗ trợ bởi khoa học
  • Nhận dạng các loại thảo mộc bằng hình ảnh
  • Bản đồ GPS tương tác - gắn thẻ các loại thảo mộc vào vị trí (sắp ra mắt)
  • Đọc các ấn phẩm khoa học liên quan đến tìm kiếm của bạn
  • Tìm kiếm dược liệu theo tác dụng của chúng
  • Sắp xếp sở thích của bạn và cập nhật các nghiên cứu tin tức, thử nghiệm lâm sàng và bằng sáng chế

Nhập một triệu chứng hoặc một căn bệnh và đọc về các loại thảo mộc có thể hữu ích, nhập một loại thảo mộc và xem các bệnh và triệu chứng mà nó được sử dụng để chống lại.
* Tất cả thông tin dựa trên nghiên cứu khoa học đã được công bố

Google Play badgeApp Store badge