Azerbaijani
Albanian
Arabic
Armenian
Azerbaijani
Belarusian
Bengali
Bosnian
Catalan
Czech
Danish
Deutsch
Dutch
English
Estonian
Finnish
Français
Greek
Haitian Creole
Hebrew
Hindi
Hungarian
Icelandic
Indonesian
Irish
Italian
Japanese
Korean
Latvian
Lithuanian
Macedonian
Mongolian
Norwegian
Persian
Polish
Portuguese
Romanian
Russian
Serbian
Slovak
Slovenian
Spanish
Swahili
Swedish
Turkish
Ukrainian
Vietnamese
Български
中文(简体)
中文(繁體)
Proteins: Structure, Function and Genetics 2012-Aug

The triterpene cyclase protein family: a systematic analysis.

Yalnız qeydiyyatdan keçmiş istifadəçilər məqalələri tərcümə edə bilərlər
Giriş / Qeydiyyatdan keçin
Bağlantı panoya saxlanılır
Silvia Racolta
P Benjamin Juhl
Demet Sirim
Jürgen Pleiss

Açar sözlər

Mücərrəd

Triterpene cyclases catalyze a broad range of cyclization reactions to form polycyclic triterpenes. Triterpene cyclases that convert squalene to hopene are named squalene-hopene cyclases (SHC) and triterpene cyclases that convert oxidosqualene are named oxidosqualene cyclases (OSC). Many sequences have been published, but there is only one structure available for each of SHCs and OSCs. Although they catalyze a similar reaction, the sequence similarity between SHCs and OSCs is low. A family classification based on phylogenetic analysis revealed 20 homologous families which are grouped into two superfamilies, SHCs and OSCs. Based on this family assignment, the Triterpene Cyclase Engineering Database (TTCED) was established. It integrates available information on sequence and structure of 639 triterpene cyclases as well as on structurally and functionally relevant amino acids. Family specific multiple sequence alignments were generated to identify the functionally relevant residues. Based on sequence alignments, conserved residues in SHCs and OSCs were analyzed and compared to experimentally confirmed mutational data. Functional schematic models of the central cavities of OSCs and SHCs were derived from structure comparison and sequence conservation analysis. These models demonstrate the high similarity of the substrate binding cavity of SHCs and OSCs and the equivalences of the respective residues. The TTCED is a novel source for comprehensive information on the triterpene cyclase family, including a compilation of previously described mutational data. The schematic models present the conservation analysis in a readily available fashion and facilitate the correlation of residues to a specific function or substrate interaction.

Facebook səhifəmizə qoşulun

Elm tərəfindən dəstəklənən ən tam dərman bitkiləri bazası

  • 55 dildə işləyir
  • Elm tərəfindən dəstəklənən bitki mənşəli müalicələr
  • Təsvirə görə otların tanınması
  • İnteraktiv GPS xəritəsi - yerdəki otları etiketləyin (tezliklə)
  • Axtarışınızla əlaqəli elmi nəşrləri oxuyun
  • Təsirlərinə görə dərman bitkilərini axtarın
  • Maraqlarınızı təşkil edin və xəbər araşdırmaları, klinik sınaqlar və patentlər barədə məlumatlı olun

Bir simptom və ya bir xəstəlik yazın və kömək edə biləcək otlar haqqında oxuyun, bir ot yazın və istifadə olunan xəstəliklərə və simptomlara baxın.
* Bütün məlumatlar dərc olunmuş elmi araşdırmalara əsaslanır

Google Play badgeApp Store badge